Počiatky Centra spirituality sú spojené s menom Doc. PhDr. Michala Fedora SJ, CSc. (1929-1994), ktorý sa od konca roku 1980 začal intenzívne zaoberať vytvorením inštitúcie zameranej na štúdium a formáciu na teologickom poli. Michal Fedor zbieral dokumenty z oblasti cirkevných dejín Slovenska, v tajnosti viedol prednášky najmä na témy týkajúce sa dejín a reálií východnej cirkvi na Slovensku.
Po roku 1989 sa popri pastoračnej činnosti Michal Fedor SJ chopil iniciatívy pri zakladaní kabinetu – strediska pre spojenie Východu a Západu. Stredisko sa vyprofilovalo koncom roku 1992 na Centrum štúdia a výskumu Východ – Západ, neskôr bola vypracovaná aj koncepcia tohto inštitútu. Súčasťou Centra sa stala aj rozsiahla knižnica, pre ktorú získal Michal Fedor SJ knihy z Matice slovenskej, Moskvy, Ríma, jezuitské z Levoče (vrátane množstva archívnych materiálov), množstvo kníh prišlo ako dar od jednotlivcov.
Dňa 1. decembra 2001 bolo podľa §13 ods. 5 Zákona o vysokých školách č. 172/1990 Z.z. v znení neskorších predpisov a na základe kladného stanoviska Akademického senátu Teologickej fakulty TU zo dňa 22. novembra 2001, zriadené Centrum spirituality Východ – Západ Michala Lacka so sídlom v Košiciach, čím sa stalo vedecko-výskumným pracoviskom Teologickej fakulty Trnavskej univerzity.
Riaditelia:
1980-1994: Doc. PhDr. Michal FEDOR SJ, CSc.1994-1996: bez priameho vedenia1997-2002: ThDr. Ján BABJAK SJ2002-2004: Mgr. Milan LACH SJ2004-2007: Doc. ThDr. Jozef KYSELICA SJ, PhD.2007-2009: MgrArt. Peter DUFKA SJ2009-2011: ThDr. Milan LACH SJ2011- : Doc. ThDr. PaedDr. Šimon MARINČÁK, PhD.